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教学资料
第一讲-绪论
第二讲-系统生物学建模概述
第三讲-网络模型基础
第四讲-蛋白互作网络
第五讲-常微分方程系统建模
第六讲-转录调控网络模体
第七讲-酶促反应动力学
第八讲-代谢网络与流量分析
第九讲-流平衡分析简介
第十讲-代谢控制理论
第十一讲-信号通路建模
第十二讲-基因表达模型
第十三讲-模型的化减与耦合
第十四讲-通用建模工具
第十五讲-专用建模工具
第十六讲-细胞行为建模
10-Assign-1-BioGRID
10-Assign-2-STRING Introduction
10-Assign-3-GO (Gene Ontology)
10-Assign-4-KEGG (Kyoto Encyclopedia...
10-Assign-5-Reactome 人类生物学反应...
10-Assign-6-BioCyc
10-Assign-7-ConsensusPathDB
10-Assign-8-BRENDA
10-Assign-9-BioNumbers
10-Assign-10-基因芯片
10-Assign-11-串联质谱
10-Assign-12-酵母双杂交系统
10-Assign-13-CHIP-chip
10-Assign-14-ChIP-PET技术
10-Assign-15-RNA干扰
10-Assign-16-转基因生物
10-Assign-17-Fluorescence tracing
10-Assign-18-The interactome
10-Assign-19-生物学哲学基础
10-Assign-20-E-cell项目
10-Assign-21-Virtual Cell
10-Assign-22-JSim
10-Assign-23-基因组学
10-Assign-24-转录组学
10-Assign-25-蛋白质组学
10-Assign-26-糖组学 表观遗传组学
10-Assign-27-脂质组学
10-Assign-28-代谢物组学
10-Assign-29-表型组学
10-Assign-30-生理组学
10-Assign-31-系统组学
10-Assign-32-蛋白质芯片
11-Assign-1-大肠杆菌单基因敲除突变体...
11-Assign-2-微生物的实验室进化
11-Assign-3-新月柄杆菌的必需基因组
11-Assign-4-iGEM介绍
11-Assign-5-转录逻辑门
11-Assign-6-青蒿素的生物合成
11-Assign-7-拟南芥中多振荡子时钟负反馈
11-Assign-8-C3植物光合代谢的协同调控
11-Assign-9-遗传逻辑回路开关设计(暂缺)
11-Assign-10-基因网络中的自调控与网络...
11-Assign-11-单细胞水平基因调控
11-Assign-12-基因表达的随机性
11-Assign-13-药物发现中的系统生物学
11-Assign-14-癌症是一种系统生物学病
11-Assign-15-先天免疫的系统生物学
11-Assign-16-合成哺乳动物基因回路揭示...
11-Assign-17-BMP成形素在果蝇发育中稳...
11-Assign-18-ChIP-chip/seq/pet
11-Assign-19-microRNA跨界调控
11-Assign-20-预测基因组进化的系统生物...
11-Assign-21-体外构建DNA振荡子
11-Assign-22-自复制信息载体纳米模式
11-Assign-23-绿脓杆菌杀手的制造工程
11-Assign-24-XPPAUT软件使用(课堂演示)
12-Assign-1-翻译效率和准确性的决定因素
12-Assign-2-RAN测序揭示后生动物基因表...
12-Assign-3-实验大肠杆菌群体关键创新...
12-Assign-4-微生物社会化互作
12-Assign-5-一种生物燃料微生物的蛋白...
12-Assign-6-酵母mRNA合成与降解的动态...
12-Assign-7-拟南芥叶子生长对缺水适应...
12-Assign-8-人类细胞异倍体性响应的组...
12-Assign-9-EGF诱导的泛素化网络的蛋白...
12-Assign-10-用微流体平台测量生物分子...
12-Assign-11-用简单序列重复精确调控基...
12-Assign-12-新基因实时进化的IAD模型
12-Assign-13-酵母蛋白互作网络中的动态...
12-Assign-14-人类自噬系统的网...(暂缺)
12-Assign-15-药物发现中的蛋白界面研究
12-Assign-16-基于结构的大规模蛋白互作...
12-Assign-17-一个人工合成的转录调控子...
12-Assign-18-冷诱导RNA绑定蛋白调控基...
12-Assign-19-染色质折叠的“线串-装订...
12-Assign-20-大肠杆菌染色体物理操作的...
12-Assign-21-调控网络进化稳健性的功...
12-Assign-22-通过代谢网络预测癌症的药...
12-Assign-23-研究蛋白质中错误突变的系...
12-Assign-24-大肠杆菌氨摄取的系统模型
12-Assign-25-单细胞动力学测量
12-Assign-26-差异网络生物学
12-Assign-27-miRNA在基因调控网络中的...
12-Assign-28-蛋白动力学揭示基因表达噪...
12-Assign-29-改造大肠杆菌杀灭绿脓杆菌
12-Assign-30-构建单细胞生物计算机
13-Assign-1-高通量测序技术及其在系统...
13-Assign-2-定量蛋白质组学研究方法
13-Assign-3-亚蛋白质组学研究方法
13-Assign-4-代谢组学研究的实验方法
13-Assign-5-细胞蛋白互作的荧光报告系统
13-Assign-6-单拷贝基因染色质互作动学...
13-Assign-7-高通量测在生物和医学中的应用
13-Assign-8-酶的磷酸化调节酵母的中心代谢
13-Assign-9-定量刻画长期科学影响
13-Assign-10-酵母细胞极性系统中蛋白动...
13-Assign-11-刻画药物诱导的转录模块
13-Assign-12-稳健生物节律的一种实现机制
13-Assign-13-网络平衡控制拟南芥生物节...
13-Assign-14-基因组重构物种扩展生物功能
13-Assign-15-系统与合成生物学中的基因...
13-Assign-16-生物系统中组件频率的统一...
13-Assign-17-短链烷炔的微生物合成
13-Assign-18-新月柄杆菌染色体空间结构...
13-Assign-19-生物医药相关的回路设计策...
13-Assign-20-遗传互作图谱揭示癌细胞的...
13-Assign-21-旁系同源冲突制约转录回路...
13-Assign-22-细菌中时间控制的自组织模...
13-Assign-23-细胞生长的遍历率分析方法...
13-Assign-24-介绍系统生物学家Uri Alon
13-Assign-25-介绍系统生物学家Bernhard...
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14-Assign-1-哺乳动物翻译起始位点的定...
14-Assign-2-相互作用组在维持人群有害...
14-Assign-3-多尺度数字拟南芥预测个体生长
14-Assign-4-细胞亚群分层特征的自动识别
14-Assign-5-环境压力下蛋白的定位与功能
14-Assign-6-长非编码RNA在心脏中的表观...
14-Assign-7-蛋白互作网络中的可控性
14-Assign-8-肺癌细胞基因组进化的时空...
14-Assign-9-无标度网络中的长周期同步...
14-Assign-10-microRNA参与人类糖组学翻...
14-Assign-11-表型组学基
14-Assign-12-第三代测序技术
14-Assign-13-用微流体和纳米工具研究细...
14-Assign-14-格子光片显微术
14-Assign-15-核糖体合成的优化调控产生...
14-Assign-16-合成微生物群体中的互养
14-Assign-17-生命周期、适应性解耦与多...
14-Assign-18-多菌株大肠杆菌代谢网络揭...
14-Assign-19-整合多尺度模型揭示大肠杆...
14-Assign-20-Warburg效应研究识别抑制...
14-Assign-21-动物细胞中昼夜节律与细胞...
14-Assign-22-叶片边界的基因调控网络
14-Assign-23-在活细胞DNA中书写记忆信息
14-Assign-24-微生物转录调控的系统模型
15-Assign-1-大肠杆菌mRNA降解的基因组...
15-Assign-2-改进的ChIP-Seq方法研究酵...
15-Assign-3-染色质结合可溶性转录因子...
15-Assign-4-酪氨酸磷酸化调节蛋白互作...
15-Assign-5-整合网络分析揭示血压调控...
15-Assign-6-温度刺激下酵母的磷酸化蛋...
15-Assign-7-药物相互作用机制的系统发...
15-Assign-8-盐胁迫条件下酵母信号转导...
15-Assign-9-酵母信号通路整合的磷酸化...
15-Assign-10-三阴性乳腺癌的药物靶标识...
15-Assign-11-细菌对核糖体靶标抗生素的...
15-Assign-12-盐溶液中的蛋白聚集模型
15-Assign-13-负反馈缓冲调控变异效应
15-Assign-14-识别生物网络中的直接和间...
15-Assign-15-细菌中全局资源分配的简单...
15-Assign-16-基因表达水平均值和方差的...
15-Assign-17-基因组规模的转录动力学建...
15-Assign-18-胁迫响应平衡驱动网络模块...
15-Assign-19-细胞的权衡机制与生长的关...
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16-Assign-1-荧光各向异性方法鉴定致病...
16-Assign-2-Co-ChIP鉴定组蛋白并发修饰...
16-Assign-3-哺乳动物早期发育中的组蛋...
16-Assign-4-哺乳动物基因对错误折叠响...
16-Assign-5-酵母的驯化与分化
16-Assign-6-布氏锥形虫的编辑体结构
16-Assign-7-质谱绝对定量方法研究鼠生...
16-Assign-8-跨物种的蛋白互作网络
16-Assign-9-酵母的全局遗传互作网络
16-Assign-10-用转录组对人类突变细胞进...
16-Assign-11-哺乳动物可变转录起始对翻...
16-Assign-12-荧光原位杂交高通量检测单...
16-Assign-13-脂蛋白信号肽酶II作用的...
16-Assign-14-水稻中保守的氮调控网络模...
16-Assign-15-负频率依赖互作与微生物群...
16-Assign-16-组合细胞索引检测染色质可...
16-Assign-17-玉米发育图谱中整合组学网...
16-Assign-18-生长减速控制细胞分化
16-Assign-19-真核mRNA中的一种动态甲基...
16-Assign-20-AlphaGo
16-Assign-21-多尺度方法揭示生物网络层...
16-Assign-22-细菌持久性是对代谢流限制...
16-Assign-23-计算生物学中的深度学习
16-Assign-24-反义转录作为一种调控基因...
16-Assign-25-重写酵母核心碳代谢生产类...
16-Assign-26-人类代谢网络合成致死预测...
16-Assign-27-系统生物学标准和数据管理...
16-Assign-28-用竞争性内源RNA网络分析...
16-Assign-29-鼠胚胎干细胞中LincRNA的...
16-Assign-30-染色质调控子分析揭示水稻...
16-Assign-31-人类寿命极限的证据
16-Assign-32-DNA损伤响应随机激活与细...
16-Assign-33-人脑单核RNA测序揭示神经...
16-Assign-34-红细胞特征遗传变异的系统...
16-Assign-35-果蝇细胞的信号通路交谈研...
16-Assign-36-淀粉样蛋白自组装的原子论...
16-Assign-37-单细胞基因组测序现状
16-Assign-38-细菌转录组学:RNA horiz-o...
16-Assign-39-基于质谱的蛋白质组学
16-Assign-40-应用基于质谱的蛋白质组学
16-Assign-41-下一代蛋白质组学:走向蛋...
16-Assign-42-高分辨率网络生物学:连接...
16-Assign-43-利用群体蛋白组学对天然微...
16-Assign-44-细胞生物学的多维蛋白质组...
16-Assign-45-空间解析的转录组学及其扩...
16-Assign-46-用于保守遗传模块全局发现...
16-Assign-47-蛋白质互作精要:构建和分...
16-Assign-48-生物网络中寻找模块结构的...
16-Assign-49-酵母蛋白互作网络中枢纽蛋...
16-Assign-50-调节蛋白互作用于新疗法的...
16-Assign-51-分子互作网络的拓扑结构
16-Assign-52-酿酒酵母的转录调控网络
16-Assign-53-构建转录调控网络
16-Assign-54-RegNetwork:一个关于人和...
16-Assign-55-基因组规模代谢网络
16-Assign-56-集体空间感知支配工程细菌
17-Assign-1-转录因子绑定基因组特征的...
17-Assign-2-CrY2H-seq深覆盖互作组鉴定
17-Assign-3-高效多路荧光原位杂交
17-Assign-4-蓝藻日间生长的细胞资源优...
17-Assign-5-红色荧光蛋白mCherry开关机...
17-Assign-6-用CRISPRi高通量识别必需基因
17-Assign-7-化学交联质谱测定线粒体蛋...
17-Assign-8-抗菌超敏性的细菌进化
17-Assign-9-结肠癌代谢模式的数学模型
17-Assign-10-少数代谢物调控中心代谢基...
17-Assign-11-转录调控网络基因表达与转...
17-Assign-12-用eQTL网络研究组织中的调...
17-Assign-13-网络分析鉴定肝病特异靶点
17-Assign-14-用生物素化的dCas9原位捕捉...
17-Assign-15-祖先基因调控网络驱动癌症
17-Assign-16-用深度学习重构细胞周期和...
17-Assign-17-细菌抗药性进化的代谢约束
17-Assign-18-酵母蛋白互作网络动力学的...
17-Assign-19-用非线性动力学对复杂网络...
17-Assign-20-单细胞测序揭示神经胶质瘤...
17-Assign-21-全基因组数据预测表型识别...
17-Assign-22-嗜热真核生物中结构蛋白组...
17-Assign-23-Promoter区方向性的基态与...
17-Assign-24-抗癌药物离开其绑定位点的...
17-Assign-25-转座子插入线性放大单细胞...
17-Assign-26-肌动蛋白骨架的系统组织决...
17-Assign-27-人体组织中基因表达的遗传...
17-Assign-28-基于药物对测量的多维药物...
17-Assign-29-评价发育基因调控网络中的...
17-Assign-30-从配对表达和染色质数据模...
17-Assign-31-用深度学习自动分析高容量...
17-Assign-32-单菌视紫红质蛋白去折叠中...
17-Assign-33-赖氨酸乙酰组揭示组蛋白脱...
17-Assign-34-活矢量场揭示酵母半乳糖网...
17-Assign-35-基因调控与代谢互相依赖网...
17-Assign-36-时代到来:下一代测序技术...
17-Assign-37-单细胞测序技术的进展与应...
17-Assign-38-单细胞基因表达数据的空间...
17-Assign-39-RNA-Seq:转录组学的革命...
17-Assign-40-单细胞中空间解析的高通量...
17-Assign-41-人鼠蛋白互作网络的分析与...
17-Assign-42-动物中的小RNA生成
17-Assign-43-植物中小RNA的分类与比较
17-Assign-44-植物中小RNA的扩张世界
17-Assign-45-检测和表征环形RNA
17-Assign-46-环状RNA:形式和功能的多...
17-Assign-47-环形RNA的合成与功能
17-Assign-48-通过杂交中间体进化新的蛋...
17-Assign-49-数据驱动系统生物学的定量...
17-Assign-50-染色体基因位置对细菌生物...
17-Assign-51-生物体内lac抑止子搜素过程...
17-Assign-52-细菌细胞中转录过程的空间...
17-Assign-53-工程化合成四态基因网络模...
17-Assign-54-合成生物学:应用时代的来...
17-Assign-55-植物合成生物学
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